Aplikasi CEToolbox adalah kalkulator untuk elektroforesis kapilari. Ia bertujuan untuk memberikan beberapa maklumat mengenai pemisahan sebatian seperti suntikan hidrodinamik, jumlah kapilari, panjang pasang suntikan atau kuantiti analit yang disuntik. Aplikasi ini berfungsi dengan apa-apa jenis sistem CE.
CEToolbox adalah aplikasi percuma, yang dibangunkan dengan Java dan dikeluarkan di bawah Lisensi Apache. Kod sumber boleh didapati di laman web GitHub. Maklumat lanjut boleh didapati di https://cetoolbox.github.io.